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转录组数据分析
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      转录组分析主要包括几大类型:
1. 转录组denovo(无参)测序数据拼接及分析: 
利用trinity实现转录组denovo组装,并进行预测蛋白序列、筛选差异基因及计算表达量等功能分析的讲解。
 
 
2. 基于二代RNA-seq的差异基因分析(参照序列): 
主要利用tophat和cufflinks,cuffdiff以及cummeRbund 等工具,实现reads的mapping, 转录本的重构,转录本的表达量计算,差异基因分析以及利用cummeRbund图形化展示cuffdiff的分析结果。GO、KEGG富集等功能分析。

3. 將NCBI SRA数据库中其他转录组样本,和您提供的转录本数据结合进行分析。


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